يقع هذا المتحف في مدينة أفاميا الأثرية على بعد 60 كم عن مدينة حماة ويتوضع في مبنى تاريخي جميل كان عبارة عن خان للحجاج والمسافرين في العهد العثماني، وقد تم ترميم الخان وأصبح المتحف الوحيد الذي خصص فقط كمتحف للفسيفساء ويحوي قطع مكتشفة من جميع انحاء سورية.

يعتبر فن الفسيفساء من أجمل وأقدم فنون الزخرفة، حيث كانت تزين به واجهات وأرضيات المعابد والقصور فيعطيها شكلاً رائعاً. يوجد في متحف افاميا عشرات الوحات الفسيفسائية المعروضة بشكل فني جميل، وكلها غاية في الروعة والإتقان، واهم هذه اللوحات (فسيفساء سقراط) وهي لوحة جميلة تمثل سقراط وحوله ستة حكماء تعود إلى عامي 362 ـ 363م

ايضا يحتوي المتحف على لوحات مهمة مثل لوحة (الأمازونات) ولوحة (الوعل) و لوحة حوريات البحر وهن يقمن بمباراة للجمال تحت رعاية إله البحر "بوزيدون".

والجدير بالذكر للاسف الشديد يد الإرهاب طالت هذا المتحف موءخراً.