يعود بناء كنيسة السيدة الموجودة في حي قديم وسط مدينة اللاذقية إلى أوائل القرن الخامس الميلادي, والتي كانت تابعة لأحد الأديرة الذي عرف بدير السيدة.

السيدة( كاتيا استبريان )وهي عضو في مجلس رعية الكنيسة تحدثت لموقع المغترب السوري عن تاريخ هذه الكنيسة.

يبدأ هيكل الكنيسة بأيقونسطاس ( حامل الايقونات),وهو من حجر الرخام الأبيض وعليه نقوش بارزة لمشاهد دينية، كما تحتوي الكنيسة على عدد من الايقونات القديمة ذات القيمة الأثرية الهامة ومن بينها أيقونة السيدة مريم العذراء.

وفي غرفة تجاور الكنيسة هناك غطاء مدفن حجري قديم نقشت عليه عدة صلبان لها سمة بيزنطية وحروف يونانية قد تشوهت عبر القرون.كما يوجد جرن المعمودية وهو جرن حجري قديم.

السيدة استبريان لفتت إلى أن الكنيسة  تعرضت إلى الوهن والتصدع مع مرور الأيام مما استدعى ترميمها من الداخل والخارج عام 1721.

استبريان أضافت أنه في عام 1874 قام مطران الروم الارثوذكس بتشكيل لجنة مؤلفة من سبع شخصيات وذلك لجمع إيرادات الكنيسة ووضعها في تعليم أولاد الفقراء مجاناً.

روز جبيلي